Bak kontrol besar merupakan bak penampung terbesar yang menampung limbah cair yang berasal dari bak kontrol kecil yang ada di sekitar gedung ruang perawatan : setiap gedung ruang perawatan terdapat 4-6 bak kontrol kecil yang menjadi penyalur limbah cair yang berasal dari ruang perawatan.
Tak seperti bak kontrol kecil yang manual, bak kontrol besar mempunyai pompa mesin yang mengalirkan limbah cair ke penampungan besar ( bak equalisasi pada sistem IPAL RS). Mesin pompa ini perlu perawatan agar tidak mengalami kerusakan.